Đầu năm học 2005-2006, trường đã phát triển được phân hiệu II tại xã Đại Yên, huyện Chương Mỹ. Đến năm 2008-2009, phân hiệu II được tách ra thành một trường lấy tên là trường THPT Đặng Tiến Đông huyện Chương mỹ - TP. Hà Nội. Phân hiệu I của trường THPT Dân lập Xuân Mai được đổi tên là trường THPT Ngô Sỹ Liên.

Trên chặng đường 10 năm hình thành và phát triển, bằng chính tâm huyết và nặng tình với sự nghiệp giáo dục trên quê hương Chương Mỹ - Hà Nội, thầy giáo Nguyễn Huy Chuyển – Hiệu trưởng nhà trường đã từng bước xây dựng trường ngày càng phát triển cả về số lượng và chất lượng, đáp ứng được nhu cầu học tập của con em nhân dân trong vùng, xứng đáng là ngôi trường của dân, vì dân.

Vượt qua biết bao khó khăn, vất vả ban đầu, đến nay, nhà trường đã có sơ sở vật chất ổn định, trang thiết bị văn phòng đầy đủ với 32 phòng học kiên cố, 12 phòng học bán kiên cố, phòng máy vi tính (50 máy), hệ thống 16 camera để quản lý việc dạy và học cùng với cá phòng chức năng khác (cơ sở vật chất tăng lên gấp 20 lần).

Nhà trường có đội ngũ cán bộ, giáo viên yêu nghề, tâm huyết với sự nghiệp. Từ 09 giáo viên cơ hữu ban đầu, đến nay đã có 54 giáo viên cơ hữu và 22 giáo viên thỉnh giảng (đội ngũ giáo viên tăng lên gấp 15 lần).

Chất lượng dạy và học của trường ngày càng được nâng cao. Năm học 2000-2001, trường chỉ có 3 lớp với 119 học sinh, đến nay, trường đã có 28 lớp với hơn 1300 học sinh. Tỷ lệ học sinh lên lớp hàng năm từ 95-96%; Tỷ lệ thi đỗ tốt nghiệp hàng năm trước đây đạt 96-97%, hàng năm gần đây đạt 75-85%; Tỷ lệ đỗ vào Đại học, Cao đẳng từ 15-17% (so với thí sinh dự thi). Năm học 2007-2008, nhiều em thi đỗ vào các trường Đại học ở tốp đầu như: Đại học Bách khoa, Học viện Quân y 103…Đặc biệt có em Nguyễn Huy Tuấn đỗ vào Học viện Quân y 103… Đặc biệt có em Nguyễn Huy Tuấn đỗ vào Học viện Quân y 103 và em tuấn còn được giải “Hoa Trạng Nguyên”. 10 năm qua, nhà trường đã đào tạo được 3670 học sinh tốt nghiệp THPT. Đặc biệt, trong những năm gần đây, nhà trường đã liên kết với các trường Trung học chuyên nghiệp Lê Quý Đôn – Gia Lâm, hình thành mô hình học tập, đào tạo nghề liên thông, có quy chế mở rộng để học sinh của trường sau khi tốt nghiệp được trang bị một nghề để lập nghiệp, đồng thời đáp ứng nguyện vọng của cả những học sinh chưa hoàn thiện bậc học THPT ở địa phương yêu quý biết ơn, tin cậy với đúng nghĩa là ngôi trường của dân, vì dân.

Trên chặng đường 10 năm qua, nhà trường luôn được lãnh đạo các cấp, nhất là Huyện ủy, HĐND, UBND huyện Chương Mỹ đánh giá cao, được phụ huynh học sinh tin tưởng. Nhà trường luôn được công nhận Trường Tiên tiến; Chi bộ đảng luôn trong sạch, vững mạnh. Từ năm 2005, nhà trường được công nhận cơ quan văn hóa.

Có thể nói hiệu quả lớn nhất mà trường THPT Ngô Sỹ Liên đạt được đó là niềm vui và hạnh phúc của các em học sinh khi được đến trường. Đó cũng chính là mục tiêu mà thầy giáo Nguyễn Huy Chuyển và tập thể cán bộ giáo viên nhà trường luôn hướng tới.